冰島雷克雅未克2024年7月24日 /美通社/ -- 安進(jìn)子公司deCODE Genetics旗下科學(xué)家進(jìn)行的一項(xiàng)新研究顯示，序列變異驅(qū)動(dòng)了DNA甲基化與基因表達(dá)之間的相關(guān)性。 相同變異與各種疾病以及其他人體特征有關(guān)。
該研究今日發(fā)表于科學(xué)雜志《自然遺傳學(xué)》上，標(biāo)題為：CpG甲基化與基因表達(dá)之間的相關(guān)性由序列變異驅(qū)動(dòng)。
納米孔測(cè)序是ONT（牛津納米孔科技）開發(fā)的一項(xiàng)新技術(shù)，使我們能夠?qū)崟r(shí)分析DNA序列。 這項(xiàng)技術(shù)能夠幫助我們通過微小蛋白質(zhì)孔繪制DNA分子，電流的實(shí)時(shí)測(cè)量能夠顯示DNA中的哪些核苷酸已經(jīng)通過蛋白質(zhì)孔。 我們可以借此讀取DNA中的核苷酸序列，同時(shí)還可以從這些相同的測(cè)量中檢測(cè)核苷酸的化學(xué)變化。
其中一種變化被稱為DNA甲基化，對(duì)于決定哪些基因在特定時(shí)間被激活非常重要，科學(xué)界通常稱之為基因表達(dá)調(diào)控。 納米孔測(cè)序技術(shù)可以直接測(cè)量DNA甲基化，同時(shí)還能產(chǎn)生比現(xiàn)有技術(shù)更長(zhǎng)的DNA序列讀數(shù)。 這些進(jìn)展為科研人員提供了新的機(jī)會(huì)，使其可以測(cè)量人類基因組中所有CpG位點(diǎn)的DNA甲基化。同時(shí)，這項(xiàng)技術(shù)能夠讀取更長(zhǎng)的DNA序列，由此我們可以分別確定來(lái)自父母雙方的染色體上的DNA甲基化。
在這項(xiàng)研究中，科學(xué)家能夠?qū)pG甲基化、基因表達(dá)和序列變異的等位基因分配給親本染色體，使他們能夠在單倍型水平上研究這三組測(cè)量值之間的相關(guān)性。 該研究表明，序列變異會(huì)影響DNA甲基化，此外，其中一些變異可能與各種疾病以及其他人體特征有關(guān)。 重要的是，該研究表明，DNA甲基化與基因表達(dá)之間的相關(guān)性可以歸因于序列變異，表明了這些變異正是驅(qū)動(dòng)因素。
大多數(shù)與疾病相關(guān)的序列變異存在于非編碼基因組中，即基因組中非編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域。 因此，很難理解非編碼序列變異的致病方式。 通過研究DNA甲基化的影響，科學(xué)家能夠證明許多此類變異與此前疾病相關(guān)的序列變異相對(duì)應(yīng)，從而使我們能夠更好地了解此類變異如何導(dǎo)致疾病的發(fā)展。
